新城疫病毒感染鸡胚组织miRNAs表达谱的测序及分析

作     者：贾燕青 仇薪鑫 王相伟 谢晓刚 白军 王兴龙 杨增岐 JIA Yan-qing;QIU Xin-xin;WANG Xiang-wei;XIE Xiao-gang;BAI Jun;WANG Xing-long;YANG Zeng-qi

作者机构：杨凌职业技术学院动物工程分院/动物疫病防控陕西省高校工程研究中心陕西杨凌712100 西北农林科技大学动物医学院陕西杨凌712100 

出 版 物：《动物医学进展》 (Progress In Veterinary Medicine)

年 卷 期：2022年第43卷第8期

页      面：19-24页

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：陕西省自然科学基础研究计划项目(2021JQ-902) 陕西省教育厅一般专项研究计划项目(20JK1003) 杨凌职业技术学院“博士+高职生”工作室建设项目(BG202010) 杨凌职业技术学院自然科学研究项目(A2019071) 

主　　题：新城疫病毒 small RNA测序 miRNA 实时荧光定量PCR 

摘      要：为了阐明新城疫病毒(NDV)感染鸡胚后miRNAs表达谱的变化及NDV感染与宿主基因之间的相互作用,帮助寻找NDV防控的新靶点和方法。通过small RNA测序技术获得NDV强毒株(F48E9)和弱毒株(La Sota)感染的鸡胚内脏组织miRNAs表达谱。对差异表达的miRNAs进行分析发现,F48E9感染引起了33个miRNAs上调,31个miRNAs下调;La Sota感染引起36个miRNAs上调,25个miRNAs下调;La Sota与F48E9感染组比较,有27个miRNAs上调,22个miRNAs下调。选取10个差异表达miRNAs进行RT-qPCR验证,gga-miR-34a-5p、gga-miR-375、gga-miR-122-3p、gga-miR-187-3p、gga-miR-124a-3p、gga-miR-203a、gga-miR-205a、gga-miR-183、gga-miR-9-3p和gga-miR-451表达量与small RNA测序结果相似。对差异表达miRNAs进行靶基因预测和生物信息学富集分析发现,在NDV感染鸡胚时,差异表达的miRNAs主要参与调控细胞生长代谢、细胞周期及免疫和炎症反应等通路。研究结果分析了NDV感染后miRNAs表达变化及预测功能,为NDV防控研究提供参考。