宏基因组二代测序在鲍曼不动杆菌肺炎混合感染者诊疗中的应用

作     者：孙国先 蔡萍 刘微丽 孟丽君 侯红玲 Sun Guoxian;Cai Ping;Liu Weili;Meng Lijun;Hou Hongling

作者机构：扬州大学附属医院临床药学科扬州市225001 扬州大学附属医院重症医学科扬州市225001 扬州大学附属医院神经内科扬州市225001 

出 版 物：《中华实验和临床感染病杂志（电子版）》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Infectious Diseases(Electronic Edition))

年 卷 期：2022年第16卷第2期

页      面：115-121页

学科分类：0906[农学-兽医学] 09[农学] 

基　　金：江苏省药学会-恒瑞药学服务专项科研资助项目(No.H202129) 江苏省药学会-天晴医院药学科研项目(No.Q202050) 

主　　题：宏基因组二代测序 肺炎 支气管肺泡灌洗液 鲍曼不动杆菌 混合感染 

摘      要：目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术对重症监护病房鲍曼不动杆菌肺炎混合感染者诊疗的应用价值。方法回顾性收集扬州大学附属医院2019年1月至2021年5月同时行肺泡灌洗液mNGS技术和传统病原检测的84例肺炎患者的基本资料、细菌培养以及mNGS检测结果、抗菌药物应用等。根据鲍曼不动杆菌感染的诊断标准和mNGS检测结果,将入组患者分为定植菌组(25例)、单一感染组(29例)和混合感染组(30例)。炎性指标、辛普森菌群多样性指数(SDI)、抗菌药物使用时间、使用强度、费用和总药费为正态分布的计量资料,采用t检验或ANOVA检验分析;患者年龄分布、基础疾病、发热时间分布、不同临床疗效和治疗转归占比均采用[例(%)]表示,组间比较采用卡方检验。结果入组的84例患者传统病原和mNGS检测鲍曼不动杆菌均为阳性,其中25例鲍曼不动杆菌定植和59例鲍曼不动杆菌肺炎患者;男性44例、女性40例,年龄[65.4(62,68)]岁。mNGS检测中,30例[50.85%(30/59)]检出混合感染;传统病原检测中,3例[5.08%(3/59)]检出混合感染,显著低于mNGS检测,差异有统计学意义(χ^(2)=30.667、P0.001)。mNGS检出混合感染居前3位的病原体分别为人疱疹病毒(7例)、肺炎链球菌(5例)和耶氏肺孢子虫(5例)。定植菌组、单一感染组和混合感染组患者SDI分别为(0.77±0.11)、(0.38±0.16)和(0.34±0.17),差异具有统计学意义(F=65.411、P0.001)。单一感染组与混合感染组患者白细胞计数(t=2.211、P=0.031)、中性粒细胞比率(t=2.068、P=0.043)、C-反应蛋白(t=2.024、P=0.048)、抗菌药物费用(t=2.279、P=0.026)、抗菌药物使用强度(t=2.161、P=0.035)、住院天数(t=2.664、P=0.010)、总药费(t=2.397、P=0.020)和体温降至正常时间(t=-2.178、P=0.034)差异均有统计学意义。单一感染组患者治疗显效率高于混合感染组(82.76%vs.56.67%,χ^(2)=4.735、P=0.047)。结论肺泡灌洗液mNGS技术在检测鲍曼不动杆菌肺炎混合感染方面优势明显,能够辅助临床优选抗菌药物,促进患者康复。