香合欢EST-SSR标记开发及种间通用性研究

作     者：安琪 冯源恒 杨章旗 胡拉 AN Qi;FENG Yuanheng;YANG Zhangqi;HU La

作者机构：广西师范大学生命科学学院广西桂林541006 广西壮族自治区林业科学研究院广西马尾松工程技术研究中心南宁530002 

出 版 物：《广西植物》 (Guihaia)

年 卷 期：2022年第42卷第8期

页      面：1374-1382页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：广西科技基地和人才专项(桂科AD19254004) 广西八桂学者专项(2019A26) 

主　　题：香合欢 EST-SSR 分子标记 通用性 多态性 

摘      要：香合欢是我国南方特有的珍贵用材树种。为了对其种质资源开展群体遗传学研究,该研究根据香合欢转录组测序结果设计开发EST-SSR引物,并在黄豆树、南洋楹、黑木相思、格木等近缘树种中进行通用性分析。结果表明:(1)所开发的243对引物有171对能够成功扩增出目的条带,在香合欢、黄豆树、南洋楹、黑木相思、格木中的有效扩增率分别为63.79%、33.75%、45.68%、41.56%、14.81%;多态性比率分别为23.87%、12.20%、9.01%、3.96%、2.78%;5个物种间均通用的引物有18对。(2)通过验证共获得香合欢SSR多态性标记37个,黄豆树和南洋楹多态性标记均为10个,黑木相思多态性标记4个,格木多态性标记1个。(3)所开发的香合欢EST-SSR标记,可以满足开展香合欢群体遗传学相关研究的需要,并在黄豆树、南洋楹等近缘树种中具有较好的通用性和研究实用性。综上认为,EST-SSR标记可在香合欢、黄豆树、南洋楹、黑木相思、格木等树种的种质资源遗传多样性评价、育种材料指纹图谱构建、群体交配系统分析等方面提供可靠的研究工具,对香合欢种质资源的保护和利用具有重要意义。