瓦氏雅罗鱼Commd9基因的克隆及其在碱度胁迫下的表达分析

作     者：罗亮 常玉梅 孙博 张立民 陈炯 梁利群 LUO Liang;CHANG Yu-Mei;SUN Bo;ZHANG Li-Min;CHEN Jiong;LIANG Li-Qun

作者机构：宁波大学海洋学院/生物化学与分子生物学实验室 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所/黑龙江省特殊生境鱼类种质特性与抗逆育种重点实验室 

出 版 物：《农业生物技术学报》 (Journal of Agricultural Biotechnology)

年 卷 期：2022年第30卷第9期

页      面：1771-1782页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2020YFD0900402) 黑龙江省自然科学基金青年项目(QC2018038) 中国水产科学研究院基本科研业务费项目(2020TD56) 农业农村部淡水水产生物技术与遗传育种重点实验室开放课题(FBB2017-04) 

主　　题：瓦氏雅罗鱼 铜转运Murr1结构域9 (Commd9)基因 基因表达 碱度胁迫 

摘      要：铜转运Murr1结构域(copper metabolism Murr1 domain, COMMD)蛋白家族在生物体中广泛存在，参与机体核因子κB (nuclear factor-κB, NF-κB)活性调节、钠转运、铜代谢以及缺氧的适应性调节等生物学过程。为研究Commd9在碱度胁迫下的作用，本研究采用c DNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends, RACE)技术，首次对具有耐高碱特性的瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii) Commd9基因cDNA全长进行了克隆，命名为LwCommd9基因(GenBank No. MT013199)。该序列全长为938 bp,5’和3’非编码区分别为5和339 bp，开放阅读框为594 bp，编码蛋白含197个氨基酸，预测分子量为21.79 k D，理论等电点为5.63。系统发育分析显示，瓦氏雅罗鱼COMMD9氨基酸序列与鲤科鱼类的相似性较高，其中与鱇浪白鱼(Anabarilius grahami)相似性高达93.37%。qPCR发现，LwCommd9基因在各组织中均有分布，在肝和肾组织中表达量显著高于其他组织(P0.05)。高碳酸盐碱度胁迫下，LwCommd9基因在碱水种群瓦氏雅罗鱼肝组织中的表达量极显著下调(P0.01)，而在淡水种群瓦氏雅罗鱼肝组织中的表达量极显著上调(P0.01)，在肾组织中也有相同变化趋势。综上所述，LwCommd9基因在瓦氏雅罗鱼高碱适应过程中可能起到了关键作用，这将为后续鱼类耐高碱机制研究提供参考。