玉米CHX基因家族全基因组鉴定与表达分析

作     者：贾博为 金军 庄齐 董伟峰 才晓溪 孙明哲 孙晓丽 Jia Bowei;Jin Jun;Zhuang Qi;Dong Weifeng;Cai Xiaoxi;Sun Mingzhe;Sun Xiaoli

作者机构：黑龙江八一农垦大学农学院/作物逆境分子生物学实验室大庆163319 

出 版 物：《黑龙江八一农垦大学学报》 (journal of heilongjiang bayi agricultural university)

年 卷 期：2022年第34卷第4期

页      面：23-30,64页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金青年项目(32000212) 中央支持地方高校改革发展资金人才培养支持计划项目 黑龙江八一农垦大学大学生创新创业训练计划项目(202010223045) 黑龙江八一农垦大学基础培育计划(ZRCPY201902) 黑龙江省博士后科学基金面上项目(LBH-Z20084) 

主　　题：玉米 CHX 非生物胁迫 生物信息学 

摘      要：CHX(cation/H+exchanger)基因家族属于CPA2(cation proton antiporter 2)超家族的一员,蛋白序列的N端存在一个Na+/H+exchanger结构域。现有研究表明,植物CHX基因家族参与调控转运细胞质子和离子,在生长发育和胁迫应答中扮演重要角色。因此,研究从玉米CHX基因家族入手,首先通过全基因组水平筛选鉴定出16个玉米CHX基因。染色体定位分析表明ZmCHXs不均匀地分布在8条不同的染色体上;系统进化分析显示,16个ZmCHXs基因可分为3组,并且各组内蛋白序列和基因结构保守。组织表达特性分析发现ZmCHXs主要表达在花药中。进一步非生物胁迫表达分析结果表明,仅有GroupⅣ基因表达受冷及盐胁迫诱导。通过研究将为后续深入探究玉米CHX基因家族参与的非生物胁迫应答分子机制提供理论依据。