淡水养殖凡纳滨对虾生长相关基因HDAC1克隆及其表达分析

作     者：骆永丽 刘红 于忠利 王文雁 戴习林 LUO Yong-li;LIU Hong;YU Zhong-li;WANG Wen-yan;DAI Xi-lin

作者机构：水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学)上海201306 水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学)上海201306 上海市奉贤区水产技术推广站上海201400 

出 版 物：《南方农业学报》 (Journal of Southern Agriculture)

年 卷 期：2022年第53卷第5期

页      面：1388-1398页

学科分类：090801[农学-水产养殖] 0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：上海市科技兴农项目(2019-02-08-00-F01111) 

主　　题：凡纳滨对虾 HDAC1基因 肠道 生长调节 淡水养殖 

摘      要：【目的】分析组蛋白去乙酰基酶1基因(HDAC1)在不同淡水生长特性家系凡纳滨对虾中的表达情况,明确HDAC1基因在对虾淡水养殖过程中的功能作用,为揭示凡纳滨对虾生长调控的分子机制提供参考依据。【方法】通过RACE克隆凡纳滨对虾HADC1基因cDNA序列,利用DNAMAN、ProtParam、ProtScale、PSORT等在线软件进行生物信息学分析,以实时荧光定量PCR检测凡纳滨对虾HDAC1基因组织表达特征;选取4个家系凡纳滨对虾在1‰盐度下进行淡水养殖,养殖70 d后统计对虾存活率(RS)、日增重率、体长日增率、特定生长率(SGR)及饲料转化率(FCR),并利用实时荧光定量PCR检测凡纳滨对虾肠道中的HDAC1基因表达情况。【结果】凡纳滨对虾HDAC1基因c DNA全长3230 bp,包括67 bp的5’非编码区(5’-UTR)、1711 bp的3’非编码区(3’-UTR)及1452 bp的开放阅读框(ORF),共编码483个氨基酸残基;HDAC1基因DNA全长4692 bp,含有8个外显子和7个内含子。凡纳滨对虾HDAC1基因编码蛋白分子量为54640.22 Da,理论等电点(p I)为5.59,属于稳定的亲水性蛋白,具有1个Histone deacetylase 1结构域,无跨膜结构。凡纳滨对虾HDAC1氨基酸序列与斑节对虾HDAC1氨基酸序列的相似性最高,达99.79%。HDAC1基因在凡纳滨对虾各组织中均有表达,以在肠道中的相对表达量显著高于在其他组织中的相对表达量(P0.05);在4个家系群体中,无论是大虾还是小虾,生长慢的群体中HDAC1基因相对表达量较低,生长快的群体中HDAC1基因相对表达量较高。【结论】HDAC1基因在凡纳滨对虾各组织中均有表达,以肠道中的相对表达量最高,且HDAC1基因相对表达量与凡纳滨对虾的生长速度成正比,故推测其参与凡纳滨对虾的生长调节过程。