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2018-2019年北京市西城区6起学校急性胃肠炎聚集性疫情的GⅠ诺如病毒病原鉴定与溯源研究

Identification and tracing of norovirus GⅠ in epidemics of acute gastroenteritis in 6 schools in Xicheng district, Beijing, 2018-2019

作     者:王永全 崔海洋 吉彦莉 靳博 李伟红 刘白薇 沈玲羽 高志勇 严寒秋 Wang Yongquan;Cui Haiyang;Ji Yanli;Jin Bo;Li Weihong;Liu Baiwei;Shen Lingyu;Gao Zhiyong;Yan Hanqiu

作者机构:北京市西城区疾病预防控制中心北京100120 北京市疾病预防控制中心/食物中毒诊断溯源技术北京市重点实验室北京100013 

出 版 物:《疾病监测》 (Disease Surveillance)

年 卷 期:2022年第37卷第6期

页      面:769-776页

核心收录:

学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 1005[医学-中医学] 100705[医学-微生物与生化药学] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基  金:首都卫生发展科研专项(No.2020-2-1011) 

主  题:诺如病毒 急性胃肠炎 重组株 

摘      要:目的 分析2018-2019年北京市西城区6所学校发生的急性胃肠炎疫情GⅠ诺如病毒的基因型别特征。方法 收集2018-2019年西城区6所学校急性胃肠炎病例的粪便标本37份。采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(real-time RTPCR)对提取的GⅠ和GⅡ诺如病毒核酸进行检测。采用RT-PCR进行GⅠ诺如病毒聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分片段的扩增和测序。用诺如病毒在线分型工具对测序成功的毒株进行初步鉴定和基因分型,用BioEdit 7.***.9.0软件进行序列比对,用MEGA 6.06软件构建进化树。结果 6所学校(18,S1~S4和19,S5~S6)发生的诺如病毒急性胃肠炎疫情均为聚集性疫情,GⅠ诺如病毒核酸阳性率为83.78%(31/37),GⅡ诺如病毒未检出;聚合酶区和衣壳蛋白VP1区进化分析分别显示,1起疫情的4株诺如病毒毒株分别与GⅠ.Pd参考株和GⅠ.3b参考株在同一分支,5起疫情的19株诺如病毒毒株与GⅠ.Pb参考株和GⅠ.6a参考株在同一分支;每所学校毒株相似性为100.0%。双区分型合并结果,1起疫情由GⅠ.Pd-GⅠ.3b引起,该重组株与GⅠ.3[P13]/Hu/MT008455/2018/Shanghai/CHI相似性高达99.6%;5起疫情由GⅠ.Pb-GⅠ.6a引起,这重组株与GⅠ.6[P11]/Hu/MZ227264/2016/US相似性高达98.1%。结论 2018-2019年北京市西城区6所学校诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情分别由GⅠ.Pd-GⅠ.3b和GⅠ.Pb-GⅠ.6a重组株引起。应加强对诺如病毒重组株分子流行病学监测,为诺如病毒疫情提供预警预测的依据。

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