生防菌NCD-2菌株定量检测体系的建立及其在棉花根际定植检测中的应用

作     者：苏星 苏振贺 宣立锋 李社增 王培培 郭庆港 马平 Su Xing;Su Zhenhe;Xuan Lifeng;Li Shezeng;Wang Peipei;Guo Qinggang;Ma Ping

作者机构：河北农业大学植物保护学院河北保定071000 河北省农林科学院植物保护研究所/河北省农业有害生物综合治理中心/农业农村部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室河北保定071000 河北省农林科学院石家庄果树研究所石家庄050061 

出 版 物：《棉花学报》 (Cotton Science)

年 卷 期：2022年第34卷第2期

页      面：162-172页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基　　金：国家现代农业产业技术体系——棉花产业技术体系(CARS-15-19) 河北省重点研发计划(19226510D) 国家自然科学基金(32172487) 河北省农林科学院现代农业科技创新工程(2022KJCXZX-ZBS-1)。 

主　　题：枯草芽孢杆菌 定量检测 根际 实时聚合酶链式反应 棉花 

摘      要：【目的】建立生防枯草芽孢杆菌NCD-2菌株的定量检测体系,明确生防菌在棉花根际土壤中的定植情况。【方法】根据NCD-2菌株全基因组序列设计特异性引物;利用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术,构建NCD-2菌株的实时PCR检测体系,并检测NCD-2菌株在棉花根际的定植情况。【结果】所构建的NCD-2菌株实时PCR检测体系能够特异性地定量检测土壤中NCD-2菌株的数量。用有效活菌数10^(9)mL^(-1)的NCD-2菌液处理棉种,在灭菌土中播种后8 d和16 d,用实时PCR检测其在棉花根际土壤中的定植数量分别为1.14×10^(5) g^(-1)和9.5 ×10^(4) g^(-1),与传统计数法检测的结果(2.15 ×10^(5) g^(-1)和2.45 ×10^(5 )g^(-1))高度相关,2种方法结果的相关系数在播种后8 d时为0.99,在播种后16 d时为0.95。而将NCD-2菌株处理后的棉种播种于含有立枯丝核菌的土壤中后16 d,用实时PCR检测其在根际土壤中的定植数量为7.6×10^(5) g^(-1),此时NCD-2菌株对棉花立枯病防治效果达到67.9%。【结论】所构建的实时PCR检测体系能够准确检测NCD-2菌株在根际土壤中的定植情况,为高效使用NCD-2菌株防控病害奠定了基础。