双淬灭TaqMan探针应用于新型冠状病毒核酸检测的初步研究
Preliminary Study on A Dual⁃quencher TaqMan Probe Applied for Detection of the Nucleic Acids of SARS⁃CoV⁃2作者机构:长江大学附属第一医院荆州434021 长江大学医学部荆州434023
出 版 物:《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)
年 卷 期:2022年第38卷第4期
页 面:784-790页
核心收录:
学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
基 金:湖北省自然科学基金(项目号:2021CFB261) 题目:磷酸化通过调控多聚泛素链的结构抑制泛素⁃蛋白酶体系统功能的机制研究
主 题:新型冠状病毒 核酸检测 荧光定量PCR 双淬灭TaqMan探针
摘 要:核酸检测是新型冠状病毒肺炎(COVID⁃19)诊断的金标准。目前,临床上主要采用基于TaqMan探针的荧光定量PCR(qPCR)来检测新型冠状病毒(SARS⁃CoV⁃2)的N基因和ORF1a/b序列。在实际的核酸检测中,因采样和qPCR灵敏度问题导致的假阴性结果时有发生。为了优化SARS⁃CoV⁃2的核酸检测,我们设计了含有两个淬灭基团的双淬灭TaqMan探针,与单淬灭TaqMan探针相比,双淬灭TaqMan探针的背景荧光信号更低(161±9 vs.290±18)。同时,我们以N基因质粒和假病毒作为核酸检测的模板,发现双淬灭TaqMan探针检测体系具有更好的检测精密度(CV 1.4%vs 2.3%;0.6%vs 2.1%)以及更低的检测下限。