宁夏地区人畜BDVp24基因系统发生树构建和序列分析
Construction of phylogenetic tree and sequence analysis on BDV p24 gene in both livestock and host in Ningxia作者机构:宁夏医科大学附属医院神经内科银川750004 重庆医科大学第一附属医院神经内科
出 版 物:《中华流行病学杂志》 (Chinese Journal of Epidemiology)
年 卷 期:2010年第31卷第2期
页 面:194-198页
核心收录:
学科分类:090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)(2006AA022196) 国家自然科学基金(30760067) 宁夏自然科学基金(Nz0790) 中国博士后科学基金(20070420721)
摘 要:目的了解宁夏及其周边地区博尔纳病病毒(BDV)的感染状况和基因特征及其种系发生来源。方法采用巢式反转录实时荧光定量聚合酶链反应(FQ—nRT-PCR),检测119例病毒性脑炎(VE)患者和其密切接触的患病或健康牛205头、绵羊978只及脑血管病患者46例、多发硬化患者13例的外周血单核细胞BDVp24片段,检出的阳性序列连同前期检出的宁夏绵羊、VE患者和抑郁症患者阳性BDVp24基因序列与GenBank中5个国家7个动物种属29例BDVp24基因序列进行比对,分析其核苷酸和氨基酸序列的同源性,重新构建基因系统发生树。结果23例阳性检测标本连同3例前期检测序列基因聚合分析显示核苷酸之间的同源相似度为96.5%-100.0%,氨基酸的同源相似度为95_3%~100.O%。与德国马源性标准株HE80同源相似度较高。构建基因的系统发生树发现宁夏绵羊、VE患者和抑郁症患者同德国马和绵羊、奥地利马都各自形成了独立的支系,其余样本形成混合支系,其中宁夏的vE患者、牛、绵羊同德国马、日本绵羊形成德国-中国宁夏-日本混合支系。结论宁夏及其周边地区人和动物BDV的感染,存在区域源性BDV独立株和国外传人基因保守株的多源状态。