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孔雀粪样宏基因组DNA提取方法的优化

Optimization of Extraction Method of Metagenomic DNA from Pavo Fecal Samples

作     者:陶芬 姜玉莎 廖琦 徐扩卫 苗睿 赵浪 孙嘉良 邵博 吴培福 

作者机构:西南林业大学生命科学学院云南 昆明 

出 版 物:《生物过程》 (Bioprocess)

年 卷 期:2022年第12卷第2期

页      面:99-105页

学科分类:0906[农学-兽医学] 09[农学] 

主  题:孔雀 粪样 菌群 基因组DNA 提取 

摘      要:目的:本研究旨在优化孔雀粪样中菌群基因组DNA的提取方法,以便为后续的研究奠定基础。方法:从野生动物园和圆通山动物园采集孔雀粪样,基于粪样用量、杂质去除方法和消化酶的添加等角度优化了孔雀粪样宏基因组DNA的提取方法,并通过16S rDNA基因和ERIC的PCR扩增验证了纯化DNA的效果。结果:采用0.5 g孔雀粪样、利用丙酮和乙醇交替漂洗样品及消化液中添加CTAB是提取孔雀肠道宏基因组DNA的优化关键点,通过该方法提取的DNA可用于后续的PCR扩增。结论:根据优化的方法可有效地提取孔雀粪样中的基因组DNA,研究结果为孔雀肠道菌群的研究奠定了基础。

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