葡萄生长调控因子GRF家族基因的鉴定及表达分析
Genome-wide Identification of Grape GRF Family and Expression Analysis作者机构:河北农业大学园艺学院河北保定071000
出 版 物:《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)
年 卷 期:2022年第49卷第5期
页 面:995-1007页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学]
基 金:河北省教育厅高等学校科学技术青年基金项目(QN2020232) 河北省青年科学基金项目(C2021204146) 现代种业科技创新专项(21326310D) 河北省现代农业产业技术体系项目(HBCT2018100204)
主 题:葡萄 GRF 家族进化 种子发育 GA IAA 表达分析
摘 要:开展葡萄生长调控因子GRF(Growth-regulating factor)家族成员的基因结构、蛋白保守基序、亚细胞定位预测、同线性、系统进化树及顺式作用元件等分析;利用qRT-PCR技术开展有核和无核葡萄不同组织器官、种子发育不同时期及激素响应表达模式分析。葡萄GRF家族共有8个成员,其中7个分布于6条染色体,编码氨基酸数为213~604,所有成员均定位于细胞核。根据进化关系分为4组(A~D),同组VvGRF的外显子—内含子结构、保守基序数和类型均具有保守性。所有葡萄GRF蛋白N端均含有QLQ和WRC保守结构域,C端至少含有TQL或FFD结构域之一。同线性分析发现,VvGRF3和VvGRF4存在并联重复。VvGRF启动子区发现大量与生长发育、激素响应及胁迫响应相关顺式作用元件。大部分VvGRF在营养器官叶片中高表达,VvGRF2在生殖器官花和果实中高表达;VvGRF3和VvGRF6在无核葡萄种子发育过程中表达量显著高于有核葡萄,而VvGRF8在有核葡萄种子发育前期表达量显著高于无核葡萄;VvGRF响应GA;和IAA诱导,且大部分基因在处理0.5或1 h后下调。