病原菌分子分型监测在早期识别伤寒聚集性疫情中的应用
Early identification of a clustered epidemic of typhoid fever through pathogen molecular subtyping monitoring作者机构：新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心传染病防治所乌鲁木齐830002 传染病预防控制国家重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206
出 版 物：《中华预防医学杂志》 (Chinese Journal of Preventive Medicine)
年 卷 期：2022年第56卷第4期
页 面：433-436页
核心收录：
学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学]
主 题：伤寒 沙门菌,伤寒 基因组,细菌 脉冲场凝胶电泳 全基因组测序
摘 要：目的应用全基因组测序(WGS)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型技术鉴别新疆一起疑似聚集性伤寒疫情。方法通过新疆维吾尔自治区传染病报告系统收集5例伤寒病例,对5例病例的流行病学史进行回顾性调查,重点针对病例的诊断过程以及疑似感染来源进行调查,同时对5株分离到的伤寒沙门菌进行WGS和PFGE分析和聚类,最后结合流行病学调查结果,判定疫情性质。结果5株伤寒沙门菌的基因组序列、PFGE图谱、耐药表型和耐药基因高度一致;流行病学调查发现,5例病例曾于同一天在同一家餐馆就餐。结论结合伤寒最长潜伏期、病原菌分子分型和流行病学调查结果,可初步判定此次疫情为一起通过就餐食物而感染伤寒沙门菌的聚集性疫情。
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