NaCl处理下全缘冬青和红果冬青根系的转录组活性比较
Comparison of transcriptomic activity of Ilex integra and I. purpurea roots with NaCl treatments作者机构:南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京林业大学生物与环境学院江苏南京210037 江苏省林业科学研究院江苏南京211153
出 版 物:《南京林业大学学报(自然科学版)》 (Journal of Nanjing Forestry University:Natural Sciences Edition)
年 卷 期:2022年第46卷第3期
页 面:99-108页
核心收录:
学科分类:0832[工学-食品科学与工程(可授工学、农学学位)] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 0818[工学-地质资源与地质工程] 09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 0901[农学-作物学] 0833[工学-城乡规划学] 0713[理学-生态学] 0834[工学-风景园林学(可授工学、农学学位)]
基 金:江苏省林业科技创新与推广项目(LYKJ07) 江苏省林业科学研究院自主科研项目(ZZKY202105)
主 题:全缘冬青 红果冬青 根系 NaCl盐胁迫 转录组分析 代谢途径
摘 要:【目的】研究全缘冬青(Ilex integra)和红果冬青(I. purpurea)的根系在NaCl胁迫处理中的转录组活性差异,为进一步研究二者耐盐性差异的生理学机理奠定基础。【方法】以内含250 mmol/L NaCl的1/2浓度霍格兰德溶液对全缘冬青和红果冬青的两年生扦插苗进行盐胁迫处理,采集经0(盐处理前)、6和72 h盐处理的根系样品,提取总RNA,进行转录组测序,组装转录本,筛选差异表达基因,分析两种冬青根系中的功能富集通路和特定代谢途径的基因表达变化。【结果】全缘冬青根系盐处理6 h的差异表达基因数量为2 616,盐处理72 h为1 802;而红果冬青根系盐处理6 h的差异表达基因数量为1 831,盐处理72 h为3 490。全缘冬青盐处理6和72h根系中共同的KEGG富集途径为植物激素信号转导、亚油酸代谢、类胡萝卜素生物合成和甜菜红素生物合成,红果冬青根系6和72 h盐处理共同的KEGG富集途径为植物激素信号转导、苯丙烷生物合成和类胡萝卜素生物合成。甜菜红素生物合成和亚油酸/花生四烯酸代谢为盐胁迫处理全缘冬青根系中特有的富集代谢通路。全缘冬青中受盐胁迫正调控的过氧化氢酶基因数多于红果冬青的,并且在盐处理下其表达水平远高于红果冬青的。【结论】全缘冬青根系较强的耐盐性可能与植物激素信号转导、类胡萝卜素生物合成、甜菜红素生物合成和脂肪酸脂类代谢等生理过程相关联;盐处理下过氧化氢酶基因的高效表达也可能是全缘冬青根系具较强耐盐性的因素之一。