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野生玫瑰多态性cpDNA和ITS引物的筛选与验证

Screening and analysis of genome sequence difference in wild rose

作     者:许建军 马燕 吴其超 王宝盛 臧德奎 XU Jianjun;MA Yan;WU Qichao;WANG Baosheng;ZANG Dekui

作者机构:黄河下游国家林业局林业重点实验室山东农业大学林学院山东泰安271018 

出 版 物:《浙江农业学报》 (Acta Agriculturae Zhejiangensis)

年 卷 期:2022年第34卷第5期

页      面:1032-1038页

核心收录:

学科分类:090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学] 

基  金:国家自然科学基金(31870688) 山东省农业良种工程(2019LZGC01802) 

主  题:野生玫瑰 ITS序列 引物筛选 系统发育树 

摘      要:为了筛选出具有高多态性的cpDNA和ITS序列引物,用于研究野生玫瑰自然种群的分子谱系地理,以野生玫瑰8个种群为试材,通过12对叶绿体基因组引物和4对核基因组ITS引物的PCR扩增和PCR产物测序,筛选出trnL-trnF、rpl20-rps12、rbcl、ITS1四对具有高多态性的引物。序列变异计算与系统发育树结果显示,8个野生玫瑰种群变异较低,可划分为2支。筛选出高多态性的cpDNA引物3对和ITS引物1对,适用于研究野生玫瑰系统发育和谱系地理结构,能够进一步探究濒危物种野生玫瑰的谱系地理。

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