基于WGCNA挖掘向日葵抗列当关键基因

作     者：黄启秀 向理军 张黎 沙红 雷中华 Huang Qixiu;Xiang Lijun;Zhang Li;Sha Hong;Lei Zhonghua

作者机构：新疆农业科学院经济作物研究所乌鲁木齐830091 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年第20卷第8期

页      面：2617-2628页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：新疆维吾尔自治区创新条件(人才,基地)建设专项-青年基金项目(2019D01B27) 新疆农业科学院青年科技骨干创新能力培养项目(xjnkq-2019005) 农业部西北荒漠绿洲作物有害生物综合治理重点实验室开放基金项目(KFJJ202005)共同资助 

主　　题：向日葵(Orobanche cumana) WGCNA 列当 抗逆 共表达模块 

摘      要：全寄生植物向日葵列当(Orobanche cumana)是威胁向日葵(Helianthus annuus)生产的重要因素。为挖掘向日葵抵抗列当的关键基因,本研究以两个列当抗性差异明显的向日葵材料与列当互作后6个时间点的根部转录组数据为基础,运用权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)得到26个共表达模块,从中找到9个与样品显著关联的模块,经过功能富集分析和模块内基因表达模式分析最终确定Pink和Blue模块为与向日葵列当抗性产生相关的特异性模块,经过基因调控网络图的绘制找到15个核心基因,功能注释结果表明这些基因大部分与植物抗逆相关。本研究结果为进一步揭示向日葵抵御列当寄生的分子机制研究提供了重要线索。