细粒棘球绦虫原头节抗原Eg-00512的生物信息学分析

作     者：李莎莎 陶佳 吕咏雪 朱亚洲 赵殷奇 赵嘉庆 赵巍 LI Sha-sha;TAO Jia;LV Yong-xue;ZHU Ya-zhou;ZHAO Yin-qi;ZHAO Jia-qing;ZHAO Wei

作者机构：宁夏医科大学基础医学院宁夏银川750004 宁夏医科大学总医院 宁夏常见传染病防治重点实验室 宁夏医学科学研究所 

出 版 物：《中国病原生物学杂志》 (Journal of Pathogen Biology)

年 卷 期：2022年第17卷第1期

页      面：71-74,113页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：宁夏回族自治区重点研发计划项目(No.2019BCG01001) 宁夏自然科学基金项目(No.2020AAC02039)。 

主　　题：细粒棘球绦虫 Eg-00512蛋白 生物信息学分析 抗原表位 

摘      要：目的分析细粒棘球绦虫原头节特异性抗原Eg-00512的生物信息学特征。方法通过NCBI数据库获取Eg-00512蛋白的氨基酸序列;使用ProtParam在线软件分析Eg-00512蛋白的理化性质;采用SOMPA在线软件分析蛋白的二级结构;使用IEDB在线软件预测Eg-00512蛋白的亲水性、柔韧性、表面可及性、β-转角;应用SWISS-MODEL在线服务器分析蛋白氨基酸序列并组合模板和Eg-00512蛋白的三级结构;B细胞表位采用在线软件IEDB及BcePred综合预测,T细胞表位采用在线预测软件SYFPEITHI分析确定。结果Eg-00512蛋白由1254个氨基酸组成,理论pI值6.15;归类于稳定蛋白质,属于亲水性蛋白。Eg-00512蛋白的二级结构中α螺旋占51.28%,延伸链占17.22%,β-转角占4.78%,无规卷曲占26.71%。Eg-00512蛋白B细胞表位数量各为8个;有13个CTL和14个Th细胞优势表位。结论生物信息学方法预测细粒棘球绦虫原头节含有多个优势B、T细胞抗原表位,为包虫病的诊断和疫苗的研究奠定了理论基础。