甲基转移酶样蛋白27是结肠癌预后的生物标志物并与免疫浸润相关

作     者：王康 张军 邓牧文 剧永乐 欧阳满照 WANG Kang;ZHANG Jun;DENG Muwen;JU Yongle;OUYANG Manzhao

作者机构：南方医科大学顺德医院胃肠外科广东佛山528308 

出 版 物：《南方医科大学学报》 (Journal of Southern Medical University)

年 卷 期：2022年第42卷第4期

页      面：486-497页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学青年基金(81802879) 广东省教育厅特色创新项目(2021KTSCX015) 2020年顺德区竞争扶持人才项目(无编号) 佛山市深入推进创新驱动助力工程项目(2021043) 南方医科大学顺徳医院科研启动计划(SRSP2018001)。 

主　　题：结肠癌 甲基转移酶样蛋白27 免疫浸润 临床预后 生物信息学 

摘      要：目的探讨甲基转移酶样蛋白27(METTL27)在结肠癌中的表达、基因功能、免疫浸润和临床预后意义。方法运用R语言,通过公共数据库TCGA、GEO、HPA数据库分析33种癌谱METTL27表达水平,并鉴定结肠癌中METTL27的差异基因,通过基因功能注释和富集分析鉴定相关信号通路;应用GSVA中的ssGSEA算法进行免疫浸润分析;Wilcoxon秩和检验(连续变量)、Logistic分析评价METTL27表达与临床病理特征的相关性;Kaplan-Meier分析、单因素和多因素Cox回归分析,构建列线图和校准图分析评价METTL27表达与临床预后的相关性。qPCR及Western blot实验验证METTL27在肠癌细胞株以及16例肠癌组织中的表达水平。结果METTL27在21种肿瘤中显著高表达,结肠癌中METTL27的表达明显高于癌周组织(P0.001);METTL27进行差异分析,并鉴定了METTL27相关的差异基因,绘制了差异表达正负相关前10基因(P0.001);通过鉴定了METTL27的差异表达基因,初步对其进行了基因功能注释,发现METTL27在跨膜物质转运以及脂质代谢进程中显著富集,进一步GSEA识别了与之相关的5条信号通路;同时分析了METTL27表达与辅助T细胞、辅助T细胞2型、中央记忆型T细胞呈负相关关系(P0.001);在临床特征与预后分析中,METTL27 mRNA高表达的患者OS、DSS较差,Cox回归分析显示,METTL27表达是OS的独立预后因素;修改为:在不同肠癌细胞株以及16例肠癌组织样本中,METTL27的mRNA表达水平高于正常细胞及组织(P0.05);配对的4例肠癌组织蛋白检测也证实这一结果(P0.001)。结论METTL27在结肠癌中异常高表达,并代表了不良的临床预后;高表达的METTL27显示了更少的T细胞免疫浸润,提示METTL27可能为结肠癌的预后标记物。