基于ASFV EP402R编码蛋白CD2v的生物信息学分析

作     者：张帅 顾文源 赵云环 刘莹 左玉柱 范京惠 ZHANG Shuai;GU Wenyuan;ZHAO Yunhuan;LIU Ying;ZUO Yuzhu;FAN Jinghui

作者机构：河北农业大学动物医学院河北保定071001 河北省动物疫病预防控制中心河北石家庄050035 河北省兽医生物技术创新中心河北保定071001 

出 版 物：《河北农业大学学报》 (Journal of Hebei Agricultural University)

年 卷 期：2022年第45卷第2期

页      面：92-98页

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：河北省省级科技计划资助(21326611D 19226622D) 河北省农业产业技术体系生猪创新团队(HBCT2018110207) 

主　　题：非洲猪瘟 CD2v 作用机制 生物信息学 

摘      要：为深入了解非洲猪瘟病毒(ASFV)的EP402R编码蛋白CD2v结构与功能的关系和病毒-宿主作用机制,本研究通过在线工具对Pig/HLJ/2018中国分离株CD2v蛋白进行了遗传进化和生物信息学分析。结果显示:Pig/HLJ/2018株与格鲁吉亚Georgia 2007、Georgia 2008以及其他中国毒株处于同一分支,基因型同为Ⅱ型;同一基因型CD2v蛋白氨基酸序列一致性高达100%,不同基因型间蛋白氨基酸序列表现出差异,氨基酸一致性在76.8%~81.7%之间;该CD2v蛋白表达的蛋白大小为41.00889 kD;蛋白结构主要以无规卷曲为主;存在信号肽和跨膜区;存在4个优势B细胞表位和5个T细胞表位。结果表明:当前中国流行株为基因Ⅱ型;CD2v蛋白在ASFV入侵机体、免疫逃逸等过程中扮演重要角色,为ASFV的深入研究和ASF的防治奠定了基础。