基于TCGA数据挖掘和分子对接技术探讨CCNB1高表达在肺腺癌中的意义及柴胡皂苷D的干预机制

作     者：黄瀚 吕晓东 庞立健 HUANG Han;LYU Xiao-dong;PANG Li-jian

作者机构：辽宁中医药大学沈阳110847 辽宁中医药大学附属医院沈阳110032 

出 版 物：《中华中医药杂志》 (China Journal of Traditional Chinese Medicine and Pharmacy)

年 卷 期：2022年第37卷第3期

页      面：1714-1718页

核心收录：

学科分类：1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金面上项目(No.81373579) 辽宁省“兴辽英才计划”高水平创新团队项目(No.XLYC1808011) 辽宁省科学技术计划项目(No.2019JH2/10300023) 

主　　题：肺腺癌 细胞周期蛋白B1 TCGA数据库 分子对接 柴胡皂苷D 

摘      要：目的:基于TCGA数据挖掘及分子对接技术探究CCNB1高表达在肺腺癌中的意义及柴胡皂苷D的干预机制。方法:在TCGA数据库中获取肺腺癌相关数据,进行CCNB1基因的差异分析、配对差异分析、生存分析及其表达多重分析,发掘CCNB1基因表达与肺腺癌患者预后的相关性,并应用单因素、多因素COX回归分析CCNB1与肺腺癌患者的年龄、性别、临床分期、T分期、N分期等相关性,并判断其是否为独立预后因子;应用GSEA富集分析获取其发挥作用的机制及通路;采用分子对接技术将CCNB1与柴胡皂苷D进行对接,预测及判断其调控机制。结果:从TCGA数据库中获取肺腺癌组织535例、癌旁非癌样本59例。与癌旁非癌样本比较,肺腺癌组织中CCNB1基因表达显著升高(P0.01),CCNB1基因低表达的生存率较高表达患者显著增加(P0.01);男性肺腺癌患者CCNB1基因表达显著高于女性患者(P0.01);Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期患者CCNB1基因表达显著高于Ⅰ期(P0.01,P0.05);T2期显著高于T1期(P0.01);N1期、N2期显著高于N0期(P0.01)。临床分期、T分期、N分期、CCNB1基因表达与总的生存期密切相关(P0.01);临床分期和CCNB1基因表达可以作为独立的临床预后因子;CCNB1基因表达与细胞周期等密切相关。柴胡皂苷D与CCNB1存在结合靶点,最低结合能为-6.9 kcal/mol。结论:CCNB1基因是肺腺癌重要的临床预后因子,柴胡皂苷D可能通过调控CCNB1发挥抗肺腺癌的作用。