鳙bmi1b基因单核苷酸多态性及其与生长和体型性状的关联性
Single nucleotide polymorphisms in bmi1b and their associations with the growth and body type traits of bighead carp（Hypophthalmichthys nobilis）作者机构：大连海洋大学水产与生命学院 淡水生态与生物技术国家重点实验室湖北洪山实验室中国科学院种子创新研究院中国科学院水生生物研究所
出 版 物：《中国水产科学》 (Journal of Fishery Sciences of China)
年 卷 期：2022年第29卷第4期
页 面：503-514页
核心收录：
基 金：国家自然科学基金项目(31472268) 中国科学院战略性科技先导专项(A)(24030505)
主 题：鳙 bmi1b 单核苷酸多态性 生长性状 体型 关联性分析
摘 要：bmi1b基因作为转录抑制因子,在维持多种干细胞的自我更新和增殖活性方面起重要作用。本研究对鳙(Hypophthalmichthys nobilis) bmi1b基因进行了单核苷酸多态性发掘及其与生长和体型性状的关联性分析。鳙bmi1b全长5800 bp,包含9个外显子、8个内含子,其氨基酸序列在进化上较为保守。bmi1b在鳙下丘脑和肝脏中的表达量较高,胚胎发育阶段从未受精卵至囊胚期都有极高的表达,原肠期后表达量显著降低,具有母源基因的表达特征。采用PCR扩增产物直接测序的方法,在鳙bmi1b 3′UTR获得2个SNPs g.5224 TA和g.5550 CT。利用来源于1个鳙混合群体的169尾鱼进行SNP基因分型及其与生长和体型性状的相关性分析,结果表明:g.5224TA与体重和头高呈显著相关(PT与体重和体型性状的相关性未达到显著水平。2个SNP位点等位基因间的组合分析显示,双倍型D2(ATCC)为优势基因型组合,其体重和体型性状的平均值显著高于其他双倍型。这些结果为进一步研究鱼类bmi1b基因的功能提供了参考;同时鳙bmi1b基因SNP标记在生长和体型性状的分子育种研究中也具有良好的应用潜力。
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