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基于数据挖掘及网络药理学探讨中药灌肠治疗慢性肾疾病的核心中药及机制

The core traditional Chinese medicines and mechanism of traditional Chinese medicine enema treatment of chronic kidney disease based on data mining and network pharmacology

作     者:崔移明 彭贵军 胡心 贺林玉 吴玉 CUI Yiming;PENG Guijun;HU Xin;HE Linyu;WU Yu

作者机构:河南中医药大学第一临床医学院河南郑州450000 河南中医药大学第一附属医院肾病科河南郑州450000 

出 版 物:《西安交通大学学报(医学版)》 (Journal of Xi’an Jiaotong University(Medical Sciences))

年 卷 期:2022年第43卷第2期

页      面:286-296页

核心收录:

学科分类:1006[医学-中西医结合] 10[医学] 100602[医学-中西医结合临床] 

基  金:河南省中医药科学研究专项课题(No.2018JDZX016)。 

主  题:慢性肾脏病 网络药理学 GO KEGG 中药灌肠 分子对接 

摘      要:目的基于数据挖掘及网络药理学,分析和挖掘中国知网(CNKI)平台期刊刊发的中药灌肠治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)有效中药处方的用药规律,寻找高频核心中药,预测核心中药的潜在靶点,以探讨核心中药治疗CKD的作用机制。方法以CNKI为数据来源,检索中药灌肠治疗CKD的中医临床文献,采用SPSS Modeler 18.0统计软件,进行统计处理和关联规则分析,采用IBM SPSS Statistics 21统计软件进行聚类分析,应用BATMAN-TCM及TCMSP检索药物的有效成分及靶点,通过Genecards、OMIN、Drugbank、DisGenet、TTD、PharmGkb数据库检索疾病相关靶点,利用Venny平台筛选疾病、药物交集靶点,利用STRING数据库获取相关文件,利用Cytoscape 3.8.2软件进行可视化分析,使用Metascape数据库进行富集分析,使用微生信网站绘制气泡图,利用AutoDockTools-1.5.6软件进行分子对接预测。结果筛选有效率≥85%的中药灌肠方,共筛选出有效处方276首,涉及120味中药,19味中药频次≥10,得到18个核心药物组合,聚类分析可分成4类。可视化网络分析示“大黄、蒲公英、牡蛎、丹参、附子关联度较高,位居核心地位,对5种核心药物的潜在靶点进行预测,得到“药物-疾病交集靶点659个,核心靶点173个,其中“MAPK1、AKT1、STAT3等为关键靶点,“Progesterone、neocryptotanshinone ii、Emodin等为核心药物治疗本病的关键成分,预测其可能作用于PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、Jak-STAT信号通路等发挥作用。分子对接表明关键成分与关键靶点结合活性较好。结论基于数据挖掘及网络药理学,中药灌肠治疗CKD主要以大黄为主药,辅助温阳化瘀泄浊类药物,其核心药物的关键成分可通过调控PIK3R1等关键靶点,作用于PI3K-Akt等信号通路发挥作用;本研究为中药灌肠治疗CKD提供新思路及为临床组方用药提供用药策略,为后续进一步研究提供基础。

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