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侧翼序列获取技术研究进展

Progress on methods for acquiring flanking genomic sequence

作     者:徐纪明 朱建树 李梦真 胡晗 毛传澡 Jiming Xu;Jianshu Zhu;Mengzhen Li;Han Hu;Chuanzao Mao

作者机构:浙江大学生命科学学院植物生物学研究所杭州310058 

出 版 物:《遗传》 (Hereditas(Beijing))

年 卷 期:2022年第44卷第4期

页      面:313-321页

核心收录:

学科分类:0831[工学-生物医学工程(可授工学、理学、医学学位)] 0711[理学-系统科学] 07[理学] 08[工学] 

基  金:国家自然科学基金项目(编号:32002121)资助 

主  题:侧翼序列 质粒拯救 反向PCR 外源接头PCR 半随机引物PCR 基因组重测序 

摘      要:侧翼序列是指染色体中特定位点两侧的DNA序列,包含着候选基因、转录调控、染色体结构、生物安全等信息,在基因组学研究中具有重要的作用。侧翼序列获取技术主要应用于启动子和增强子等调控序列的克隆、鉴定T-DNA或转座子插入位点、染色体步移、全基因组空隙填补等,是结构基因组研究以及功能基因组研究的重要手段,在转基因动植物鉴定及安全管理等方面具有重要应用。随着分子生物学的发展,目前已经建立了许多侧翼序列的获取方法,依据技术原理可以分为质粒拯救法、反向PCR法、外源接头介导PCR法、半随机引物PCR法和基因组重测序法等5大类。本文系统总结了近年来侧翼序列获取技术的研究进展,并对这些技术的原理以及应用情况进行了较为系统的综述,为侧翼序列信息的获取提供参考。

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