基于高通量测序考察甘肃黄芪种植区根际土壤微生物群落结构及多样性
Examining the Structure and Diversity of Inter-root Soil Microbial Communities in Astragalus membranaceus Plantation Areas of Gansu Based on High-throughput Sequencing作者机构:甘肃省药品检验研究院甘肃兰州730060 国家药监局中药材及饮片质量控制重点实验室甘肃兰州730060
出 版 物:《中国野生植物资源》 (Chinese Wild Plant Resources)
年 卷 期:2022年第41卷第3期
页 面:15-24页
学科分类:100703[医学-生药学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 10[医学]
基 金:国家药监局中药材及饮片质量控制重点实验室项目(2020GSMPA-KL03)
主 题:黄芪 根际土壤 细菌群落多样性 真菌群落多样性 高通量测序
摘 要:采用高通量测序技术,考察分析甘肃6个不同黄芪种植区黄芪根际微生物菌群结构特征。结果表明,甘肃黄芪种植的六个地区其根际土壤细菌分属于31个门、97个纲、211个目、330个科、614个属、共1163个种,根际土壤真菌分属于13个门、46个纲、98个目、202个科、412个属、共656个种。细菌在门水平的群落结构特征主要为放线菌门(Actinobacteriota)和变形菌门(Proteobacteria),其中宕昌县采集的样本中以变形菌门为优势菌群,其余地区为放线菌门。真菌在门水平的群落结构主要为子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和被孢霉门(Mortierellomycota),六个种植地区优势真菌均为子囊菌门(Ascomycota),相对丰度均在75%以上。6个黄芪种植区中,基于种水平的微生物群落进行主坐标分析,宕昌黄芪种植区的根际土壤细菌群落结构和渭源县种植区根际土壤真菌群落结构组成不同于其它地区。