分子动力学模拟研究A1408G突变对核糖体16S rRNA片段的影响
Molecular Dynamics Studies on the Structure of 16S rRNA Fragment Affected by A1408G Mutation作者机构:吉林大学计算机科学与技术学院长春132012
出 版 物:《高等学校化学学报》 (Chemical Journal of Chinese Universities)
年 卷 期:2010年第31卷第9期
页 面:1815-1819页
核心收录:
学科分类:081704[工学-应用化学] 07[理学] 070304[理学-物理化学(含∶化学物理)] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 0703[理学-化学]
主 题:核糖体 16SrRNAA位点 巴龙霉素 分子动力学
摘 要:利用分子动力学模拟方法,研究了原核生物核糖体小亚基中的16SrRNA片段与氨基糖苷类抗生素巴龙霉素复合物结构的柔性.结果表明,16SrRNA片段中的1408位点的腺嘌呤(A)突变为鸟嘌呤(G),改变了与tRNA中反密码子环识别相关的2个腺嘌呤A1492和A1493的空间构象,阻碍了氨基糖苷类抗生素与核糖体的结合,从而影响原核生物蛋白转录过程.模拟结果与实验测定的晶体结构相吻合,可为基于核糖体16SrRNA的药物分子设计提供较可靠的结构信息.