物种形成过程中的分化基因组岛及其形成机制

作     者：孙琼 王嵘 陈小勇 Qiong Sun;Rong Wang;Xiaoyong Chen

作者机构：华东师范大学生态与环境科学学院上海200241 华东师范大学浙江天童森林生态系统国家野外科学观测研究站上海200241 

出 版 物：《生物多样性》 (Biodiversity Science)

年 卷 期：2022年第30卷第3期

页      面：115-131页

核心收录：

学科分类：0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 0711[理学-系统科学] 07[理学] 08[工学] 

基　　金：国家自然科学基金(31870356 31630008) 

主　　题：成种 基因流 F_(ST) 基因组分化景观 种群基因组 

摘      要：理解物种形成机制是生态和进化领域的重要任务。得益于测序技术的快速发展,越来越多研究发现分化种群(亚种、物种)间的基因组常呈现异质性分化景观,存在分化基因组岛,这被认为是基因流存在下的歧化选择引起的,支持基因流存在下的成种假说。然而,基因渐渗、祖先多态性的差异分选、连锁选择等其他进化过程也可导致分化基因组岛的形成。现有实证研究在解析分化基因组岛的形成机制时,往往忽略了上述其他进化过程的作用。为此,本文在辨析分化基因组岛相关概念的基础上,总结了利用种群基因组数据鉴定分化基因组岛的方法,对比了不同进化过程形成分化基因组岛的特征,指出在区分不同机制时联用基因渐渗程度、绝对分化指数(dXY)、相对节点深度(RND)、重组率等多个指标的必要性,归纳了物种形成过程中分化基因组岛形成机制解析的研究思路,并对未来在生殖隔离机制上的深入探索以及实证研究的整合分析等方面进行了展望。