玉米COBRA家族成员全基因组鉴定与表达模式分析

作     者：潘倚天 黄敏 PAN Yitian;HUANG Min

作者机构：长江大学生命科学学院湖北荆州434025 

出 版 物：《甘肃农业科技》 (Gansu Agricultural Science and Technology)

年 卷 期：2022年第53卷第2期

页      面：67-72页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家自然科学基金面上项目(31771801、32072069) 湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队计划项目(T201704) 

主　　题：玉米 COBRA基因家族 纤维素 表达模式 生物信息学 

摘      要：COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定的植物特异性蛋白,在初生和次生细胞壁的纤维素生物合成中发挥重要作用。通过生物信息学方法,从玉米基因组中发现了9个COBRA家族基因,并对其基因结构、系统发育和表达模式等进行了分析。结果表明,9个COBRA家族基因都含有CCVS保守结构域,并且均定位于细胞膜上。系统进化分析结果显示,该家族可以分为2个亚族,每个亚族内的基因具有相似的基因结构和理化性质。基因表达分析结果表明,所有COBRA家族成员响应多种非生物胁迫,且当植株受到紫外照射处理时,ZmCOBL1~ZmCOBL3和ZmCOBL7~ZmCOBL9这6个基因均表现出上调应答。