蒺藜苜蓿全基因组中U-box基因家族的筛选与特征分析
Genome-wide screening and characterization of the U-box gene family in Medicago truncatula作者机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193
出 版 物：《草业学报》 (Acta Prataculturae Sinica)
年 卷 期：2015年第24卷第8期
页 面：130-141页
核心收录：
学科分类：090503[农学-草业科学] 0909[农学-草学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学]
基 金：国家自然科学基金(31372362)项目 "十二五"国家科技支撑计划(2011BAD17B01)资助
摘 要：植物基因组中广泛存在U-box基因,其编码蛋白大部分作为泛素系统中决定底物特异性识别的E3泛素连接酶,广泛地调控植物生长生殖发育以及响应逆境胁迫等过程。本文利用蒺藜苜蓿基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定蒺藜苜蓿U-box家族基因;采用MEGA6软件进行系统进化树分析;通过GSDS在线工具和Mapinspect软件进行基因结构及染色体定位分析;利用已有的蒺藜苜蓿芯片数据进行组织表达和胁迫响应表达分析。结果表明,蒺藜苜蓿基因组中含有41个U-box基因,不均匀地分布于蒺藜苜蓿的8条染色体上。根据结构域组成和系统进化分析将这些U-box蛋白分成6类。基因表达模式分析发现,该家族成员的表达具有一定的组织特异性,并能响应盐、干旱和氮素胁迫。这些研究结果为蒺藜苜蓿U-box基因家族的功能分析奠定了基础。
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