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空间转录组技术研究进展

Advances in Spatial Transcriptome Technologies

作     者:危莹 张小丹 胡苗苗 吴忠琴 程酩 郭妍 WEI Ying;ZHANG Xiao-Dan;HU Miao-Miao;WU Zhong-Qin;CHENG Ming;GUO Yan

作者机构:上海交通大学生物医学工程学院上海200240 

出 版 物:《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期:2022年第49卷第3期

页      面:561-571页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基  金:国家重点研发计划(2018YFC1003500) 国家自然科学基金(81972909)资助项目 

主  题:空间转录组 组学技术 空间位置 单细胞 

摘      要:空间转录组技术旨在对细胞的基因表达进行定量测量,同时提供细胞在组织空间的具体位置信息。与传统的转录组技术相比,空间转录组技术能获得细胞在组织生理环境下真实的基因表达特征,以及与微环境的关系,进一步推进对正常和病理状态下细胞特性的理解。近年来,空间转录组技术的发展取得了重要的进展,检测的细胞通量、转录本数量和质量不断提高,空间定位信息更加准确全面。本文总结了四大类不同空间转录组技术的特点和应用,并比较了目前不同空间转录组技术的优缺点。

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