新发林麝环状类病毒的鉴定和分析

作     者：刘齐 杨世兴 张文 齐敦武 付为国 LIU Qi;YANG Shixing;ZHANG Wen;QI Dunwu;FU Weiguo

作者机构：江苏大学农业工程研究院镇江212013 江苏大学医学院镇江212013 成都大熊猫繁育研究基地四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室成都610081 

出 版 物：《中国动物传染病学报》 (Chinese Journal of Animal Infectious Diseases)

年 卷 期：2022年第30卷第1期

页      面：39-43页

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家重点研发计划(2017YFC1200201) 国家自然基金(81741062) 

主　　题：林麝 环状病毒 病毒宏基因组学 基因组结构分析 系统发育分析 

摘      要：利用病毒宏基因组学(viral metagenomics)方法,本研究从95份林麝粪便样品中检测到1株新型圆环病毒样(Circoviruslike)病毒,经过拼接获得其全基因组序列,该毒株命名为ls-cyc。其基因组全长约3552 nt,GC含量39.00%,含有2个开放阅读框(ORF),即ORF1和ORF2。其中ORF1长度为1386 nt,ORF2长度为1953 nt。ORF1编码的氨基酸序列与来自猪血清圆环状病毒的(MH170058.1)序列相似度为34.31%。系统进化分析表明其与来自猪的圆环状病毒(MH170058.1)和鸭相关环状病毒(NC_030134.1)为同一进化分支。该病毒是否与林麝特定疾病相关有待于进一步流行病学研究。