灯盏花及多舌飞蓬叶绿体基因组特征与系统发育分析

作     者：田星 李中霁 刘小莉 李国栋 

作者机构：云南中医药大学云南省傣医药与彝医药重点实验室 云南中医药大学云南省中医药分子生物学重点实验室 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(202105AC160050) 云南省高层次人才培养计划(YNWR-QNBJ-2020-278) 云南省应用基础研究—中医联合面上项目(2018FF001-039)共同资助 

主　　题：灯盏花 多舌飞蓬 叶绿体基因组 SSR 系统发育 

摘      要：本研究利用二代测序技术Illumina Hiseq平台对飞蓬属(Erigeron)药用植物灯盏花(Erigeron Breviscapus)及其近缘种多舌飞蓬(Erigeron multiradiatus)进行了叶绿体全基因组测序，通过生物信息学分析方法进行序列组装、注释和基本结构分析，并将其与19个已发表的植物叶绿体全基因组进行了系统发育分析。结果显示，叶绿体全基因组长度范围为152 175～152 372 bp，大单拷贝区的范围为84 684～84 881 bp，小单拷贝区的范围为18 102～18 133 bp，两个反向重复区的范围为24 667～24 699 bp。叶绿体全基因组中的GC含量范围为37.1%～37.2%，共注释到129个基因，其中蛋白编码基因(PCGs) 84个，tRNA基因37个，rRNA基因8个。在飞蓬属叶绿体基因组中共检测到简单重复序列88～92个，长重复序列47～49个；此外，在变异热点区域筛选到9个高变片段。系统发育结果显示，多舌飞蓬与灯盏花以100%的支持率聚为一支，互为姊妹群。本研究结果将为灯盏花保护遗传学和资源开发利用等研究提供理论基础。