连翘叶绿体基因组特征分析

作     者：宋芸 贾孟君 曹亚萍 李政 贺嘉欣 王勇飞 张鑫瑞 乔永刚 SONG Yun;JIA Mengjun;CAO Yaping;LI Zheng;HE Jiaxin;WANG Yongfei;ZHANG Xinrui;QIAO Yonggang

作者机构：山西农业大学生命科学学院山西太谷030801 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2022年第49卷第1期

页      面：187-199页

核心收录：

学科分类：090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学] 

基　　金：山西省基础研究计划面上项目(20210302123390)。 

主　　题：连翘 异型花柱 叶绿体基因组 SSR 密码子偏好性 系统发育分析 

摘      要：为探究连翘叶绿体基因组特征及该属物种的系统进化发育关系,利用高通量测序技术对连翘长花柱与短花柱植株叶绿体基因组进行测序和功能注释,利用PCR对高通量测序结果进行验证。结果显示:连翘长花柱与短花柱植株叶绿体基因组全长均为156 386bp,为典型的四段式结构。连翘叶绿体基因组注释到114个基因,包括80个蛋白编码基因,30个tRNA基因,4个rRNA基因。基因组56个简单重复序列(SSR)位点分析显示其SSR序列主要由A和T碱基组成。连翘叶绿体基因组编码区偏向使用A、T碱基,但整体密码子偏好性较弱,主要表现在Arg和Ser的差异。与已公布的32种植物(包括14种连翘属)叶绿体基因组序列构建系统发育进化树,结果显示连翘的叶绿体基因组与产自山西泽州的连翘高度同源。连翘异型花柱具有相同的叶绿体基因组序列,推测连翘的异型花柱是由同型花演化而来。