绵羊ZAP基因克隆与生物信息学分析
Cloning and Bioinformatics Analysis of Ovis Aries Zap Gene作者机构:中国农业科学院上海兽医研究所上海200241 安徽农业大学动物科技学院合肥230000
出 版 物:《中国动物传染病学报》 (Chinese Journal of Animal Infectious Diseases)
年 卷 期:2022年第30卷第1期
页 面:179-184页
学科分类:090602[农学-预防兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:国家重点研发计划项目(2016YFD0500108,2016YFD0501003) 上海市科技兴农创新项目(沪农科创字(2019)第3-3号) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2019JB06)。
摘 要:锌指抗病毒蛋白(ZAP)是一种重要的宿主限制性因子,能够抑制多种病毒的增殖。为研究绵羊ZAP(oZAP)的生物信息学特征和对该蛋白功能进行预测,本研究通过PCR扩增oZAP基因,其长度为2697 bp,编码898个氨基酸;生物信息学分析显示oZAP蛋白中丝氨酸(Ser)含量最高,半衰期为30 h,属于不稳定的亲水性蛋白;该蛋白不存在信号肽及跨膜结构,存在114个潜在的磷酸化位点和5个糖基化位点,二级结构预测中,参与形成无规则卷曲的氨基酸最多;功能结构域预测发现,该蛋白存在锌指域、WWE域和多聚核糖聚合酶功能域。本研究为进一步研究oZAP蛋白的抗病毒作用提供了有价值的信息。