利用双树复小波特征进行蛋白质二级结构预测
Prediction of Secondary Structure of Protein Using Dual-Tree ComplexWavelet Transform作者机构：江南大学理学院江苏无锡214122
出 版 物：《计算机工程与应用》 (Computer Engineering and Applications)
年 卷 期：2022年第58卷第3期
页 面：230-234页
学科分类：1305[艺术学-设计学（可授艺术学、工学学位）] 13[艺术学] 081104[工学-模式识别与智能系统] 08[工学] 0804[工学-仪器科学与技术] 081101[工学-控制理论与控制工程] 0811[工学-控制科学与工程]
基 金：国家自然科学基金青年基金(61402202) 中国博士后科学基金(2015M581724) 江苏省博士后科学基金(1401099C)
主 题：蛋白质 二级结构预测 双树复小波变换 纹理特征 支持向量机
摘 要：识别蛋白质二级结构对于蛋白质的特征和性质研究具有很重要的作用。用Cα原子三维空间坐标把蛋白质序列映射为距离矩阵,针对距离矩阵中隐含的纹理信息,用双树复小波变换对矩阵进行4级分解,提取不同方向的子带能量和标准偏差,得到48维特征向量来表示蛋白质的二级结构特征,再将提取的特征输入KNN和SVM分类器分类,通过实验验证,双树复小波特征能改善传统特征提取方法的纹理粒度和方向局限问题,提高蛋白质二级结构的预测准确率。
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