慢性粒细胞白血病耐伊马替尼细胞系的转录组分析

作     者：韩笑 邓之奎 张成婉 于亮 刘小宁 HAN Xiao;DENG Zhi-Kui;ZHANG Cheng-Wan;YU Liang;LIU Xiao-Ning

作者机构：南京医科大学附属淮安第一医院中心实验室江苏淮安223300 南京医科大学附属淮安第一医院血液科江苏淮安223300 

出 版 物：《中国实验血液学杂志》 (Journal of Experimental Hematology)

年 卷 期：2021年第29卷第6期

页      面：1714-1718页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(81500128)。 

主　　题：慢性粒细胞白血病 伊马替尼耐药 转录组 

摘      要：目的:探讨调控慢性粒细胞白血病(CML)耐伊马替尼的基因,以提高CML耐伊马替尼患者的治疗效果。方法:选取伊马替尼敏感细胞系K562和耐药细胞系K562/G01,采用RNA-seq方法获得对应细胞的转录组,并进行标准生物信息学分析。结果:相较于K562细胞,耐伊马替尼细胞K562/G01转录组中共有464个表达显著变化的基因,其中163个基因表达上调,301个基因表达下调。GO功能注释分析和KEGG通路的富集分析结果显示,差异基因主要集中在氧化磷酸化、蛋白细胞器定位、核糖核蛋白复合体的生物发生等生物学过程。GSEA基因富集分析表明,有5个基因集在K562/G01中被显著的上调,如TGF-beta信号通路、mTOR信号通路、慢性粒细胞白血病相关信号通路等。结论:CML细胞伊马替尼耐药与细胞中氧化磷酸化过程有关,在耐药过程中TGF-beta信号通路、mTOR信号通路发生显著上调。