半夏SSR分子标记开发与遗传多样性

作     者：张景 李晓东 宗庆波 何贝贝 拉基 景纳良 王柯月 钟淑梅 舒少华 ZHANG Jing;LI Xiaodong;ZONG Qingbo;HE Beibei;LA Ji;JING Naliang;WANG Keyue;ZHONG Shumei;SHU Shaohua

作者机构：华中农业大学植物科学技术学院武汉430070 湖北省果茶办公室武汉430070 九州通医药集团九信中药研究院武汉430051 

出 版 物：《华中农业大学学报》 (Journal of Huazhong Agricultural University)

年 卷 期：2021年第40卷第6期

页      面：19-26页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家重点研发计划项目“中药材生态种植技术研究及应用”(2017YFC1700700) 湖北省技术创新重大项目“湖北省重点道地药材品种选育及配套关键技术研究”(2017ACA175) 知音英才计划项目“半夏优良品种培育及产业化” 湖北省农业科技创新行动 

主　　题：半夏 转录组 简单重复序列分子标记 遗传多样性 居群 

摘      要：对半夏转录组数据进行分析,设计开发SSR引物,利用筛选出的SSR引物分析不同居群间半夏的遗传多样性,为半夏分子标记辅助育种提供支撑。结果显示:筛选出的19对多态性较高的引物在17个半夏居群中共检测到49个多态性位点,具有较高的多态性;利用UPGMA作图共将17个半夏居群分为3个类群;通过分子方差分析(AMOVA)发现半夏居群内的变异达到88%,说明群体与群体间的差异相对较小,遗传变异主要来源于个体间;居群间平均分化系数Fst为0.124,居群间基因流Nm值为1.765,表明居群间能正常地进行基因交流,且居群间遗传分化受基因流的影响较大。本研究利用SSR技术开发的19对SSR引物在不同半夏居群间具有一定的通用性、多态性,能将17份半夏材料明确区分。