赫氏颗石藻(Emiliania huxleyi)响应病毒感染的microRNA转录组分析

作     者：张恩权 蔡伟聪 李桂玲 李健 刘静雯 Enquan Zhang;Weicong Cai;Guiling Li;Jian Li;Jingwen Liu

作者机构：集美大学食品与生物工程学院厦门361000 

出 版 物：《遗传》 (Hereditas（Beijing))

年 卷 期：2021年第43卷第11期

页      面：1088-1100,I0020-I0053页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金面上项目(编号:42076086,31771972) 福建省自然科学基金(编号:2019J01696,2020J01676)资助 

主　　题：赫氏颗石藻 颗石藻病毒 small RNA测序 microRNA 脂代谢 

摘      要：海洋颗石藻病毒–宿主互作是影响海洋碳、硫生物地化循环及全球气候变化的重要环节。作为大的双链DNA病毒,颗石藻病毒进化出一种“病毒细胞代谢模式,通过重编程宿主代谢途径以满足其代谢需求,但对这一代谢模式的调控机制尚缺乏足够的认识。MicroRNA(miRNA)作为一种基因表达调控的重要因子,能够通过调控代谢过程中的靶基因表达,从而调节相关代谢通路。本研究采用small RNA测序技术分析病毒感染颗石藻差异表达的miRNA及其靶基因功能,鉴定出26条成熟miRNA(包括2条病毒来源的miRNA),均来自23条新的miRNA前体序列,其中5条miRNA显著差异表达,包括4条上调,1条下调。实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证结果与miRNA-seq结果基本一致。功能富集分析显示,5个差异表达的miRNA可能参与调节糖代谢、脂代谢和氨基酸等代谢。此外,差异表达miRNA的表达水平与脂质代谢相关靶基因如ACC-1、SPT、ACOX、ACAT、CERS、ACADS等的表达水平呈负相关,说明这些miRNA可能在病毒感染过程中对宿主的脂质代谢发挥重要的调控作用。