杨树ERF、MYB和NAC转录因子家族基因耐盐胁迫表达特性分析

作     者：樊艳 王星斗 黄娟娟 王升级 韩有志 FAN Yan;WANG Xingdou;HUANG Juanjuan;WANG Shengji;HAN Youzhi

作者机构：山西农业大学林学院山西晋中030801 

出 版 物：《植物生理学报》 (Plant Physiology Journal)

年 卷 期：2021年第57卷第8期

页      面：1668-1678页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 

基　　金：国家自然科学基金(31800564) 山西省高校科技创新基金(2019L0392) 山西农业大学科技创新基金(2017YJ21)。 

主　　题：杨树 盐胁迫 转录因子 基因表达 生物信息学 

摘      要：植物转录因子是一种广泛存在于植物体中,参与植物生长发育调控和抗逆胁迫过程的重要基因家族。为筛选杨树耐盐胁迫相关转录因子,分析其分子生物学功能及应答盐胁迫表达模式,本研究采用生物信息学方法,筛选出杨树ERF、MYB、NAC三类转录因子家族中与盐胁迫相关的目的基因20个。对其理化性质、序列同源性、启动子顺式作用元件及基因功能注释进行系统分析,发现有2个基因(Potri.012G060300和Potri.017G082500)参与了刺激响应过程。同时,基于RNA-seq测序数据表达模式分析发现,在正常条件下Potri.012G060300基因在芽、叶、茎组织中的表达量较高;盐胁迫处理后,表达量均降低。Potri.017G082500基因在正常条件下芽中的表达量较高,在茎中的表达量相对较低;在盐胁迫处理后,该基因在芽和叶中的表达量均较高,在茎中的表达量较低。此外,通过对20个基因进行表达相关性分析,发现3组基因(7个)间存在较强的表达相关性。