婴幼儿血管瘤的microRNA-circRNA芯片分析

作     者：车霄楠 沙岩 王丹 CHE Xiao-Nan;SHA Yan;WANG Dan

作者机构：徐州市儿童医院徐州医科大学附属儿童医院口腔科徐州221000 徐州医科大学医学信息与工程学院徐州221000 

出 版 物：《中国免疫学杂志》 (Chinese Journal of Immunology)

年 卷 期：2021年第37卷第20期

页      面：2498-2501,2506页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100102[医学-免疫学] 10[医学] 

基　　金：徐州市推动科技创新专项资金(KC19061)项目。 

主　　题：婴幼儿血管瘤 差异表达基因 miRNA circRNA 

摘      要：目的:筛选比较婴幼儿血管瘤(IH)组织与血管瘤临近正常皮肤组织中miRNA、circRNA的差异表达情况。方法:从GEO数据库获取IH组织的miRNA及circRNA芯片数据,使用GEO2R工具分别对其进行差异分析,筛选差异表达分子。使用RNAhybrid工具构建差异表达分子的miRNA-circRNA相互作用关系。通过KEGG数据库分析差异表达的miRNAs参与的信号通路。结果:差异分析共得到139个差异表达的miRNAs和1000个差异表达的circRNAs。RNAhybrid工具预测得到354条相互作用关系,共涉及81个DEMis和35个DECis。对DEMis的KEGG通路分析发现,有14个差异miRNAs参与了肺癌、食管癌、肝细胞癌、结肠癌、乳腺癌、上皮性卵巢癌、膀胱癌及前列腺癌的信号通路。结论:14个差异表达的miRNAs富集在癌症发生通路,可能参与IH的发生和发展。