甘蓝型油菜遗传图谱构建及偏分离标记分析

作     者：代文东 铁拿优 玛丽亚 张超 唐容 王少铭 王璐璐 饶勇 黄泽素 

作者机构：贵州省农业科学院油料研究所 苏兰拉里理工大学农学院 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2021年

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家自然科学基金(31660405) 贵州省科学技术基金(黔科合基础﹝2016﹞1418) 国家自然科学基金后补助资金专项(黔农科院国基后补助﹝2021﹞08号)共同资助 

摘      要：以甘蓝型紫叶油菜‘10-Zi006’为父本、绿叶油菜‘10-4438’为母本杂交，以10-4438回交构建BC;作图群体并基于简化测序构建连锁遗传图谱，为甘蓝型油菜叶片花青素含量等性状QTL定位奠定基础。利用DArT-Seq技术对分离群体进行基因分型，共获得3 404个SNP标记和5 968个in silico DArT标记，筛选高质量SNP标记构建框架遗传图谱，在此基础上，通过“固定标记位置顺序的方法，逐步添加包含偏分离标记在内的其他SNP标记及in silico DArTs标记，利用MSTmap在线分析软件，最终构建了一张包含9 212个多态性标记、1 614个标记位点、覆盖3 616.38 cM的遗传连锁图谱，该图谱平均遗传距离2.24 cM，包含21个连锁群，覆盖甘蓝型油菜19条染色体。在构图的9 212个多态性标记中，偏分离标记（p0.05）共计767个，占总标记数的8.33%，偏分离标记在染色体上表现为成簇分布且形成热点区域；主要分布在A2、A1、C4、C6染色体上，其中A2染色体340个多态性标记全部为偏分离标记，占总偏分离标记的44.33%。本研究为甘蓝型油菜叶片花青素含量等性状的遗传解析及改良打下了基础。