最大似然法和贝叶斯推论与似然比检验探讨泽泻目系统发育关系

作     者：刘涛 李晓贤 LIU Tao;LI Xiao-Xian

作者机构：云南农业大学农学院昆明650201 中国科学院昆明植物研究所昆明650204 

出 版 物：《广西植物》 (Guihaia)

年 卷 期：2010年第30卷第6期

页      面：796-804页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071001[理学-植物学] 07[理学] 

基　　金：国家自然科学基金(30800062)~~ 

主　　题：最大似然法 贝叶斯推论 似然比检验 泽泻目系统发育分析 rbcL序列 

摘      要：应用最大似然法(ML)、贝叶斯推论(BI)、邻接法(NJ)和似然比检验(hLRTs)进行泽泻目分子系统学研究。所用的rbcL基因序列代表了泽泻目14科46属以及作为外类群的6相关属。研究结果表明,*等级制似然比检验表明泽泻目rbcL序列最适合的DNA进化模型为GTR+I+G,最大似然法、贝叶斯法和邻接法构建的系统发育树拓扑结构相似,没有显著的差异,但贝叶斯树支持率较高;泽泻目为一单系类群,由两个主要谱系分支构成,深层分布格局由5个主要分支构成。基于分子系统发育树,文中对泽泻目科间、水鳖科+茨藻科、泽泻科+花蔺科+黄花蔺科、和Cymodoeaceae complex的系统发育关系进行了讨论。研究结果还表明,泽泻目系统发育关系可能还需要更多的证据进一步的澄清。