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几种滇产龙胆属Gentiana药用植物的DNA超级条形码研究

DNA super-barcoding of several medicinal species in Gentiana from Yunnan province

作     者:胡海粟 张德全 HU Hai-su;ZHANG De-quan

作者机构:大理大学药学院云南大理671000 大理大学药物研究所云南大理671000 

出 版 物:《中国中药杂志》 (China Journal of Chinese Materia Medica)

年 卷 期:2021年第46卷第20期

页      面:5260-5269页

核心收录:

学科分类:1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基  金:国家自然科学基金项目(32060091,31660081) 云南省教育厅科学研究基金项目(2021Y402) 

主  题:龙胆属 药用植物 叶绿体全基因组 DNA超级条形码 物种鉴定 

摘      要:龙胆属Gentiana为龙胆科中一个具有重要药用价值但种属比较复杂的类群。该属包含众多药用植物种类,其物种鉴定比较困难。该研究利用Illumina Hisep 2500测序平台对几种滇产龙胆属药用植物(滇龙胆草***、红花龙胆***和微籽龙胆***)进行二代测序,经组装、注释得到3条完整的叶绿体全基因组序列,并结合已发表的粗茎秦艽***数据,对DNA超级条形码在龙胆属中的物种鉴定进行初步研究。研究发现,滇龙胆草、红花龙胆、微籽龙胆的叶绿体全基因组总长相对较短(分别为146944、148992、148796 bp),共注释得到114个基因,包括78个蛋白编码基因、30个tRNA基因、4个rRNA基因及2个假基因,其叶绿体基因组比较保守。同时,以叶绿体全基因组作为DNA超级条形码,对4种滇产龙胆属药用植物进行物种鉴定。结果表明,这几种龙胆属植物均聚为明显的单系分支,且具有较高的支持率(100%)。这说明DNA超级条形码,在龙胆属这类复杂类群的物种鉴定上具有较大优势。该研究结果将为龙胆属药用植物的准确鉴定、开发利用及其资源保护提供科学依据。

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