广西香稻Badh2基因两种功能标记的开发

作     者：曾宇 杨行海 夏秀忠 农保选 张宗琼 徐志健 陈灿 邓国富 李丹婷 Zeng Yu;Yang Xinghai;Xia Xiuzhong;Nong Baoxuan;Zhang Zongqiong;Xu Zhijian;Chen Can;Deng Guofu;Li Danting

作者机构：广西壮族自治区农业科学院南宁530007 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所广西水稻遗传育种重点实验室南宁530007 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2021年第19卷第18期

页      面：5917-5932页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2019M12) 广西自然科学基金项目(2019JJA130104) 广西特色作物试验站项目(上思香稻试验站)共同资助 

主　　题：香稻 标记辅助育种 荧光分子标记 实时荧光PCR 

摘      要：水稻的香味是一种重要的食味品质性状,是水稻第8号染色体Badh2基因突变导致其功能缺失,引起芳香活性物质2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)的积累从而产生香味。Badh2基因至少存在18个等位突变位点,利用等位突变位点辅助培育香稻被证明是一个有效手段。传统Sanger测序法和SSR分子标记PCR电泳分析进行位点检测效率较低。为了开发效率更高的检测方法,本研究利用了实时荧光PCR检测技术对广西地方常见的水稻突变荧光分子标记。对40份广西地方香稻的Badh2基因进行直接测序,发现这些香稻的Badh2基因主要存在两种突变,第4、5外显子806 bp缺失(badh2-E4-5.1)和第7外显子8 bp缺失(badh2-E7)。针对这两种突变类型设计实时荧光PCR检测方法,并对已测序的40份香稻进行验证,实时荧光PCR检测的准确性达到93.75%。进一步对50份地方品种进行香味基因型分型鉴定,其中24份香稻为badh2-E4-5,22份香稻为badh2-E7。本研究针对广西地方香稻品种的主要两种突变类型,设计开发了这两种等位基因的荧光分子标记,适用于香稻基因型的鉴定筛选,对香稻育种具有重要的现实意义。