葡萄GRF基因家族的生物信息学分析

作     者：王晓芳 昌秦湘 王淑芳 闫钊 李戌彦 Gary Gao 纪薇 Wang Xiaofang;Chang Qinxiang;Wang Shufang;Yan Zhao;Li Xuyan;Gary Gao;Ji Wei

作者机构：山西农业大学园艺学院太谷030801 太原学院园艺系太原030012 山西省畜牧兽医学校太原030024 美国俄亥俄州立大学美国哥伦布0H43210 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2021年第19卷第18期

页      面：5975-5983页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：山西省高等学校青年科研人员培育计划(2019) 山西省研究生教育创新项目(2020SY196)共同资助 

主　　题：葡萄(Vitis vinifera L.) GRF基因家族 生物信息学 

摘      要：GRF(Growth-regulating factor)基因家族是一种广泛分布于种子植物的转录因子,在调节植物的生长、发育中发挥重要的作用。本研究从葡萄基因组鉴定出8个VvGRF基因,命名为VvGRF1~VvGRF8。采用生物信息学的方法,系统地对葡萄Vv GRF家族的蛋白理化性质、进化关系、保守基序及在不同发育时期的差异性表达进行预测和分析。结果表明,VvGRF基因内含子与外显子数量差异较小,在所有预测蛋白的N端含有两个典型的保守结构域QLQ与WRC;系统进化分析将GRF家族成员分为6组,其中葡萄与甜瓜的亲缘关系较拟南芥、番茄两种双子叶植物近;顺式作用元件表明,调控分生组织、胚、种子发育及生长素、赤霉素等信号传导和逆境胁迫响应元件,在VvGRFs启动子序列中大量存在;基因特异性表达分析显示,多数GRF基因在葡萄发育的花后2周、10周时期的表达丰富度高,在接近成熟时期的表达丰富度较低,表明GRF在葡萄生长、转色早期起着重要的作用,参与组织、器官的生长调节。本研究为进一步探究葡萄GRF基因家族的结构及生长发育时期的功能调节提供了参考依据。