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T细胞受体(TCR)库及其高通量测序常用分析工具

T cell receptor(TCR)repertoire and common analytical tools for high-throughputs equencing

作     者:张敏敏 李俊 石彬 姚新生 ZHANG Minmin;LI Jun;SHI Bin;YAO Xinsheng

作者机构:遵义医科大学免疫学教研室贵州遵义563000 

出 版 物:《细胞与分子免疫学杂志》 (Chinese Journal of Cellular and Molecular Immunology)

年 卷 期:2021年第37卷第9期

页      面:851-857页

核心收录:

学科分类:1205[管理学-图书情报与档案管理] 12[管理学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100102[医学-免疫学] 120502[管理学-情报学] 10[医学] 

基  金:国家自然科学基金(81760300) 

主  题:T细胞受体(TCR)库 高通量测序 国际免疫基因信息系统(IMGT) 综述 

摘      要:T细胞受体(TCR)是T细胞识别抗原的关键部分,个体中所有的TCR总和称为TCR库。研究机体健康或患病状态下TCR库的组成及特征有助于我们更好地理解适应性免疫。目前已有大量针对高通量数据的分析工具,分析内容包括基本组成分析和下游功能分析等。抗原特异性T细胞数据库的建立为临床研究提供基础,对TCR库功能特征的分析是重点与难点,但现阶段已发布的下游分析工具还有待更多的实践与验证。我们总结了几种常用的TCR库分析工具,为非生物信息专业的科研人员选择分析工具提供参考。

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