基于DTM-PCR、MIRU-VNTR和耐药基因测序的武汉市耐多药结核分枝杆菌的分子分型

作     者：段琼红 陈军 周美兰 胡严杰 李月华 邬俊 张正斌 王桂阳 吴刚 DUAN Qionghong;CHEN Jun;ZHOU Meilan;HU Yanjie;LI Yuehua;WU Jun;ZHANG Zhengbin;WANG Guiyang;WU Gang

作者机构：武汉市肺科医院武汉430030 

出 版 物：《公共卫生与预防医学》 (Journal of Public Health and Preventive Medicine)

年 卷 期：2021年第32卷第5期

页      面：38-42页

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：湖北省自然科学基金(2018CFB641) 湖北省卫健委项目(WJ2021M026) 武汉市卫健委项目(WG20A03) 北京医卫健康公益基金会课题(YWJKJJHKJJJ-B17289-Q4) 武汉市卫计委项目(WG15A04) 

主　　题：分枝杆菌 结核 广泛耐药结核 基因型 

摘      要：目的描述武汉市耐多药结核(multidrug-resistant tuberculosis,MDR-TB)分枝杆菌基因型分布及成簇特征。方法采用目标缺失多重PCR(Deletion-Targeted Multiplex,DTM-PCR)、24位点MIRU-VNTR(mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat typing)以及耐药基因测序方法,对武汉市149株耐多药结核分枝杆菌进行分子分型,计算Hunter-Gaston分辨指数(Hunter-Gaston discriminatory index,HGDI),成簇率以及近期感染率最小估计值。结果全部MIRU位点的累积HGDI为0.9944。QUB11b位点的HGDI最高(0.6738)。联合采用DTM-PCR以及MIRU-VNTR,共鉴定出111个独立基因型和11个成簇基因型(38株),成簇率为25.50%,近期感染率最小估计为18.12%。经过耐药基因测序进一步分型,各簇内共有17(44.74%)个菌株有相同的突变位点,其余21个菌株突变位点不相同。结论联合采用DTM-PCR、24位点MIRU-VNTR分型和耐药基因测序,其基因分型分辨率较高,适合于武汉地区耐多药结核分枝杆菌的基因分型。武汉市MDR-TB的发生大多由于内源性复燃引起,但仍有一定的近期传播率。