一种新的RNA二级结构特征序列表示及相似性分析
New representation for characteristic sequence of RNA secondary structure and analysis of similarity/dissimilarity作者机构：湖南大学计算机与通信学院长沙410082
出 版 物：《计算机应用研究》 (Application Research of Computers)
年 卷 期：2011年第28卷第3期
页 面：969-971,979页
核心收录：
学科分类：081203[工学-计算机应用技术] 08[工学] 0835[工学-软件工程] 0812[工学-计算机科学与技术（可授工学、理学学位）]
主 题：RNA二级结构 特征序列表示 相似性分析 Lempel-Ziv复杂度
摘 要：针对目前不同的RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题,提出了一种新的RNA二级结构特征序列表示法,根据不同的RNA二级结构的子结构类型,分别给出相应的字符表示并由此得到新的特征序列。利用Lempel-Ziv复杂度对两组RNA二级结构进行了相似性分析,实验结果表明了该表示法可以有效地提取RNA二级结构的结构信息,避免了不同RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题。
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