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水稻B3转录因子OsL1的生信分析及表达模式

Analysis of Bioinformatics and Expression Pattern of Rice B3 Transcription Factor OsL1

作     者:李磊 邱牡丹 董皓 沈泓 宋书锋 李懿星 王天抗 黎燕霞 张龙辉 李莉 王建龙 Li Lei;QiuMudan;DongHao;Shen Hong;Song Shufeng;Li Yixing;Wang Tiankang;Li Yanxia;Zhang Longhui;Li Li;Wang Jianlong

作者机构:湖南农业大学农学院长沙410128 湖南杂交水稻研究中心杂交水稻国家重点实验室长沙410125 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2021年第19卷第15期

页      面:4880-4886页

学科分类:09[农学] 0901[农学-作物学] 

基  金:国家自然科学基金项目(31901530)资助 

主  题:水稻 B3家族 亚细胞定位 表达模式 

摘      要:B3转录因子是植物特有的转录因子,与植物花形态建成、激素信号转导、种子生长发育及植物逆境胁迫响应密切相关。前期研究中,利用穗发育芯片筛选到一个OsL1基因。生物信息学分析发现,OsL1基因位于水稻4号染色体,基因全长4262 bp,编码433个氨基酸,蛋白分子量为48.7 kD,序列比对和系统发育分析表明OsL1属于B3家族转录因子,不含信号肽剪切位点和跨膜结构域,亚细胞定位于细胞核。启动子序列分析发现,该基因启动子中含有8个光响应元件及部分激素响应元件。实时PCR分析发现OsL1在水稻根、茎、叶、和穗中均有表达,其中在根和穗发育7期表达量较高,进一步克隆OsL1启动子区域,构建pCAMBIA1301-OsL1-GUS表达载体,遗传转化并鉴定获得转基因植株,The previous study在水稻根、茎、叶、和穗中均检测到了GUS信号,表明OsL1属于组成型表达。以上结果为深入研究OsL1基因在水稻生长发育过程的生物学功能提供了科学依据。

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