纤维素降解菌烟曲霉HZ1的基因组测序及生物信息学分析

作     者：唐昊 郑莉 雷露 王明珺 李沅秋 罗朝兵 Hao Tang;Li Zheng;Lu Lei;Mingjun Wang;Yuanqiu Li;Chaobing Luo

作者机构：乐山师范学院生命科学学院四川乐山614000 

出 版 物：《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)

年 卷 期：2021年第61卷第8期

页      面：2382-2396页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：四川省科技计划(2019YFG0139) 

主　　题：烟曲霉HZ1 长足大竹象 基因组测序 生物信息学分析 纤维素酶 纤维素降解真菌 

摘      要：【目的】烟曲霉Aspergillus fumigatus作为一类具有纤维素降解能力的真菌,对其基因组的研究,将有利于从***中挖掘和开发利用与纤维素降解相关的酶资源。【方法】利用CMC选择培养基和刚果红染色法从长足大竹象肠道中分离和筛选出纤维素降解菌*** HZ1,同时采用Illumina PE150平台进行基因组测序,随后进行了相关的生物信息学分析,此外还利用了DNS法测定了其纤维素酶活。【结果】纤维素降解菌*** HZ1基因组大小为27.45 Mb,GC含量为49.43%;通过NR、KOG、GO、Swissprot、eggNOG、KEGG和Pfam数据库注释结果表明基因组包含9473个基因;同时碳水化合物活性酶(CAZyme)注释结果表明基因组含有534个CAZyme基因,并与其他4种***基因组CAZyme分布无显著差异;本研究还鉴定出多种与木质纤维素降解相关的纤维素酶基因、半纤维素酶基因和木质素酶基因;此外纤维素酶活结果表明,在CMC培养基中其酶活呈上升趋势且具有较高活性。【结论】本研究首次对*** HZ1基因组进行了测序和分析,探讨了其纤维素降解的遗传基础,并通过酶活验证了其纤维素降解潜力,为该菌的实际应用提供了理论基础。