固氮施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501同化硝酸盐代谢基因簇分布及调控研究

作     者：黄丽玲 李耘 王珊珊 陆超 杨智敏 林敏 燕永亮 陈明 张维 王劲 周正富 柯秀彬 战嵛华 陆伟 HUANG Liling;LI Yun;WANG Shanshan;LU Chao;YANG Zhimin;LIN Min;YAN Yongliang;CHEN Ming;ZHANG Wei;WANG Jin;ZHOU Zhengfu;KE Xiubin;ZHAN Yuhua;LU Wei

作者机构：中国农业科学院生物技术研究所北京100086 

出 版 物：《中国农业科技导报》 (Journal of Agricultural Science and Technology)

年 卷 期：2021年第23卷第7期

页      面：72-81页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31930004,31770067) 中国农业科学院科技创新工程重大科研项目(CAAS-ZDRW202009) 

主　　题：施氏假单胞菌A1501 硝酸盐同化 基因簇 途径特异性控制 

摘      要：固氮施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501在有氧条件下能够利用硝酸盐/亚硝酸盐为唯一氮源生长,表明该菌除了具有固氮和反硝化等氮循环系统外还有同化硝酸盐/亚硝酸盐系统。为进一步阐明该菌同化硝酸盐的代谢机制,利用生物信息学手段分析了硝酸盐同化相关基因的组成及分布情况,并初步研究了同化硝酸盐途径特异性调控关系。结果表明,*** A1501中存在两个硝酸盐同化基因簇nasST-nasA-nirBDnasBcobA和nasR-nasFED,分布于基因组不同部位。第一个基因簇中nasS-nasT编码二元抗转录终止因子,nasA编码NarK/NasA家族硝酸盐转运蛋白,nirBD编码亚硝酸盐还原酶,nasB编码同化硝酸盐还原酶,cobA编码参与西罗血红素合成的尿卟啉-ⅢC-甲基转移酶;第二个基因簇中nasR编码单一组分抗转录终止因子,nasFED编码ABC型(ATP依赖)硝酸盐/亚硝酸盐转运蛋白。NasS-NasT双组分蛋白调控硝酸盐/亚硝酸盐还原酶基因的转录,NasR调控硝酸盐/亚硝酸盐转运蛋白基因的转录。